您好，一，此時由A企業(yè)提出開具紅字發(fā)票申請單，發(fā)票由A企業(yè)開具。二，此時由B企業(yè)提出開具紅字發(fā)票申請單，發(fā)票由A企業(yè)開具。請參考以下文件。 
國家稅務總局 
關于紅字增值稅發(fā)票開具有關問題的公告 
國家稅務總局公告2016年第47號 
  為進一步規(guī)范納稅人開具增值稅發(fā)票管理，現(xiàn)將紅字發(fā)票開具有關問題公告如下： 
  一、增值稅一般納稅人開具增值稅專用發(fā)票（以下簡稱“專用發(fā)票”）后，發(fā)生銷貨退回、開票有誤、應稅服務中止等情形但不符合發(fā)票作廢條件，或者因銷貨部分退回及發(fā)生銷售折讓，需要開具紅字專用發(fā)票的，按以下方法處理： 
  （一）購買方取得專用發(fā)票已用于申報抵扣的，購買方可在增值稅發(fā)票管理新系統(tǒng)（以下簡稱“新系統(tǒng)”）中填開并上傳《開具紅字增值稅專用發(fā)票信息表》（以下簡稱《信息表》，詳見附件），在填開《信息表》時不填寫相對應的藍字專用發(fā)票信息，應暫依《信息表》所列增值稅稅額從當期進項稅額中轉出，待取得銷售方開具的紅字專用發(fā)票后，與《信息表》一并作為記賬憑證。 
  購買方取得專用發(fā)票未用于申報抵扣、但發(fā)票聯(lián)或抵扣聯(lián)無法退回的，購買方填開《信息表》時應填寫相對應的藍字專用發(fā)票信息。 
  銷售方開具專用發(fā)票尚未交付購買方，以及購買方未用于申報抵扣并將發(fā)票聯(lián)及抵扣聯(lián)退回的，銷售方可在新系統(tǒng)中填開并上傳《信息表》。銷售方填開《信息表》時應填寫相對應的藍字專用發(fā)票信息。 
  （二）主管稅務機關通過網(wǎng)絡接收納稅人上傳的《信息表》，系統(tǒng)自動校驗通過后，生成帶有“紅字發(fā)票信息表編號”的《信息表》，并將信息同步至納稅人端系統(tǒng)中。 
  （三）銷售方憑稅務機關系統(tǒng)校驗通過的《信息表》開具紅字專用發(fā)票，在新系統(tǒng)中以銷項負數(shù)開具。紅字專用發(fā)票應與《信息表》一一對應。 
  （四）納稅人也可憑《信息表》電子信息或紙質(zhì)資料到稅務機關對《信息表》內(nèi)容進行系統(tǒng)校驗。 
  二、稅務機關為小規(guī)模納稅人代開專用發(fā)票，需要開具紅字專用發(fā)票的，按照一般納稅人開具紅字專用發(fā)票的方法處理。 
  三、納稅人需要開具紅字增值稅普通發(fā)票的，可以在所對應的藍字發(fā)票金額范圍內(nèi)開具多份紅字發(fā)票。紅字機動車銷售統(tǒng)一發(fā)票需與原藍字機動車銷售統(tǒng)一發(fā)票一一對應。 
  四、按照《國家稅務總局關于納稅人認定或登記為一般納稅人前進項稅額抵扣問題的公告》（國家稅務總局公告2015年第59號）的規(guī)定，需要開具紅字專用發(fā)票的，按照本公告規(guī)定執(zhí)行。 
  五、本公告自2016年8月1日起施行，《國家稅務總局關于推行增值稅發(fā)票系統(tǒng)升級版有關問題的公告》（國家稅務總局公告2014年第73號）第四條、附件1、附件2和《國家稅務總局關于全面推行增值稅發(fā)票系統(tǒng)升級版有關問題的公告》（國家稅務總局公告2015年第19號）第五條、附件1、附件2同時廢止。此前未處理的事項，按照本公告規(guī)定執(zhí)行。 
  特此公告。 
   
  附件：開具紅字增值稅專用發(fā)票信息表   
國家稅務總局 
2016年7月20日