民營醫(yī)院增值稅稅率一般納稅人是6%，小規(guī)模納稅人征收率3%，疫情期間1%。

不過從事醫(yī)療事業(yè)有優(yōu)惠，比如：

根據(jù)《財政部 國家稅務(wù)總局關(guān)于醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)有關(guān)稅收政策的通知》(財稅[2000]42號)的規(guī)定：

(1)非營利性醫(yī)療機構(gòu)按照國家規(guī)定的價格取得的醫(yī)療服務(wù)收入，免征各項稅收.醫(yī)療服務(wù)是指醫(yī)療服務(wù)機構(gòu)對患者進行檢查、診斷、治療、康復(fù)和提供預(yù)防保健、接生、計劃生育方面的服務(wù)，以及與這些服務(wù)有關(guān)的提供藥品、醫(yī)用材料器具、救護車、病房住宿和伙食的業(yè)務(wù)；

(2)對營利性醫(yī)療機構(gòu)取得的收入，直接用于改善醫(yī)療衛(wèi)生條件的,自取得執(zhí)業(yè)登記之日起，3年內(nèi)給予下列優(yōu)惠:對其取得的醫(yī)療服務(wù)收入免征營業(yè)稅。

(3)對疾病控制機構(gòu)和婦幼保健機構(gòu)等衛(wèi)生機構(gòu)按照國家規(guī)定的價格取得的衛(wèi)生服務(wù)收入(含疫苗接種和調(diào)撥、銷售收入),免征各項稅收。