依據(jù)《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》第五十條規(guī)定，居民企業(yè)在中國境內(nèi)設(shè)立不具有法人資格的營業(yè)機(jī)構(gòu)的，應(yīng)當(dāng)匯總計(jì)算并繳納企業(yè)所得稅”。具體根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)《跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法》的公告》（國家稅務(wù)總局公告2012年第57號(hào)）規(guī)定進(jìn)行繳納，具體如下：

1、 匯總納稅企業(yè)實(shí)行“統(tǒng)一計(jì)算、分級(jí)管理、就地預(yù)繳、匯總清算、財(cái)政調(diào)庫”的企業(yè)所得稅征收管理辦法；

2、 總機(jī)構(gòu)和具有主體生產(chǎn)經(jīng)營職能的二級(jí)分支機(jī)構(gòu)，就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。二級(jí)分支機(jī)構(gòu)，是指匯總納稅企業(yè)依法設(shè)立并領(lǐng)取非法人營業(yè)執(zhí)照（登記證書），且總機(jī)構(gòu)對(duì)其財(cái)務(wù)、業(yè)務(wù)、人員等直接進(jìn)行統(tǒng)一核算和管理的分支機(jī)構(gòu)。

3、 匯總納稅企業(yè)按照《企業(yè)所得稅法》規(guī)定匯總計(jì)算的企業(yè)所得稅，包括預(yù)繳稅款和匯算清繳應(yīng)繳應(yīng)退稅款，50%在各分支機(jī)構(gòu)間分?jǐn)?，各分支機(jī)構(gòu)根據(jù)分?jǐn)偠惪罹偷剞k理繳庫或退庫；50%由總機(jī)構(gòu)分?jǐn)偫U納，其中25%就地辦理繳庫或退庫，25%就地全額繳入中央國庫或退庫。具體的稅款繳庫或退庫程序按照財(cái)預(yù)[2012]40號(hào)文件第五條等相關(guān)規(guī)定執(zhí)行。

4、 以總機(jī)構(gòu)名義進(jìn)行生產(chǎn)經(jīng)營的非法人分支機(jī)構(gòu)，無法提供匯總納稅企業(yè)分支機(jī)構(gòu)所得稅分配表，也無法提供本辦法第二十三條規(guī)定相關(guān)證據(jù)證明其二級(jí)及以下分支機(jī)構(gòu)身份的，應(yīng)視同獨(dú)立納稅人計(jì)算并就地繳納企業(yè)所得稅，不執(zhí)行本辦法的相關(guān)規(guī)定。

因此，除第4條所列情況外，分支機(jī)構(gòu)繳納企業(yè)所得稅，應(yīng)由總機(jī)構(gòu)統(tǒng)一計(jì)算企業(yè)應(yīng)納稅所得額和應(yīng)納所得稅額，并分別由總機(jī)構(gòu)、分支機(jī)構(gòu)按月或按季就地預(yù)繳。

分支機(jī)構(gòu)繳納金額，由總機(jī)構(gòu)計(jì)算分配，具體是總機(jī)構(gòu)在每月或每季終了之日起10日內(nèi)，按照上年度各省市分支機(jī)構(gòu)的營業(yè)收入、職工薪酬和資產(chǎn)總額三個(gè)因素計(jì)算各分支機(jī)構(gòu)應(yīng)分?jǐn)偹枚惪畹谋壤?，三個(gè)因素的權(quán)重依次為0.35、0.35、0.30，計(jì)算分支機(jī)構(gòu)應(yīng)分?jǐn)偟钠髽I(yè)所得稅。