農(nóng)產(chǎn)品是計算抵扣。當期允許抵扣農(nóng)產(chǎn)品增值稅進項稅額=從農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者手中購進農(nóng)產(chǎn)品，按收購發(fā)票和銷售發(fā)票，注明的買價和9%扣除率計算進項稅。

農(nóng)產(chǎn)品加計扣除1%的計算：納稅人購進用于生產(chǎn)或委托加工13%稅率貨物的農(nóng)產(chǎn)品，按照10%的扣除率計算進項稅額，即對農(nóng)產(chǎn)品深加工給予1%的加計扣除?？梢缘挚鄣倪M項稅額=原材料成本×1%。如果是以購進農(nóng)產(chǎn)品為原料生產(chǎn)銷售液體乳及乳制品、酒及酒精、植物油的一般納稅人，納入農(nóng)產(chǎn)品增值稅進項稅額核定扣除試點范圍。購進農(nóng)產(chǎn)品為原料生產(chǎn)特定貨物共有三種核定方法：投入產(chǎn)出法、成本法、參照法計算核定扣除。

當期允許抵扣農(nóng)產(chǎn)品增值稅進項稅額:

（1）投入產(chǎn)出法=當期農(nóng)產(chǎn)品耗用數(shù)量*農(nóng)產(chǎn)品平均購買單價*扣除率/（1+扣除率）；

（2）成本法=當期主營業(yè)務(wù)成本*農(nóng)產(chǎn)品耗用率*扣除率/（1+扣除率）；

（3）參照法：對新辦的試點納稅人或者試點納稅人新增產(chǎn)品的，試點納稅人可參照所屬行業(yè)或者生產(chǎn)結(jié)構(gòu)相近的其他試點納稅人確定農(nóng)產(chǎn)品單耗數(shù)量或者農(nóng)產(chǎn)品耗用率。次年，試點納稅人向主管稅務(wù)機關(guān)申請核定當期的農(nóng)產(chǎn)品單耗數(shù)量或者農(nóng)產(chǎn)品耗用率，并據(jù)此計算去確定當年允許抵扣的農(nóng)產(chǎn)品增值稅進項稅額，同時對上一年增值稅進項稅額進行調(diào)整。核定的進項稅額超過實際抵扣增值稅進項稅額的，其差額部分可以結(jié)轉(zhuǎn)下期繼續(xù)抵扣；核定的進項稅額低于實際抵扣增值稅進項稅額的，其差額部分應(yīng)按現(xiàn)行增值稅的有關(guān)規(guī)定將進項稅額做轉(zhuǎn)出處理。