稅務(wù)局代開運(yùn)費(fèi)發(fā)票的稅率是6%。這是國家稅務(wù)總局規(guī)定的，即服務(wù)費(fèi)、運(yùn)費(fèi)、運(yùn)雜費(fèi)等在國內(nèi)運(yùn)輸過程中產(chǎn)生的費(fèi)用，均應(yīng)繳納6%的增值稅，應(yīng)由稅務(wù)機(jī)關(guān)代開發(fā)票。例如，某物流公司在國內(nèi)運(yùn)輸過程中產(chǎn)生1000元的運(yùn)費(fèi)，則需要繳納60元的增值稅，稅務(wù)機(jī)關(guān)會(huì)代開一張1000元運(yùn)費(fèi)發(fā)票，其中增值稅部分為60元，其他部分為940元。