一般納稅人銷售種子，農(nóng)藥，化肥開的專票稅率為3%。根據(jù)《企業(yè)所得稅法》第四十七條的規(guī)定，開具增值稅專用發(fā)票的稅率為3%。拓展知識：在開具增值稅專用發(fā)票的過程中，購買方和銷售方都應(yīng)該嚴(yán)格遵守相關(guān)的稅收規(guī)定，確保發(fā)票的真實性、準(zhǔn)確性和完整性，以便更好地納稅。