企業(yè)代扣代繳個人所得稅取得的手續(xù)費不能繳納增值稅，因為手續(xù)費并不屬于營業(yè)收入。根據(jù)《中華人民共和國增值稅條例》第十六條規(guī)定，“營業(yè)性收入”是指企業(yè)從事營業(yè)活動所獲得的各類應(yīng)稅收入，其中包括銷售貨物、提供勞務(wù)、轉(zhuǎn)讓土地使用權(quán)、轉(zhuǎn)讓無形資產(chǎn)及接受委托辦理各類業(yè)務(wù)所取得的有形收入。 
 
以一家有限責(zé)任公司為例，該公司負責(zé)為個體工商戶代扣代繳個人所得稅服務(wù)，于年度收取每一家個體工商戶的20元手續(xù)費，根據(jù)規(guī)定，該公司的收入不屬于營業(yè)收入，因此不能繳納增值稅。