小微企業(yè)虧損時需要繳納附加稅。根據(jù)《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》的規(guī)定，小微企業(yè)虧損時，可以將其稅前扣除項目（包括資本金、印花稅等），用于減免繳納的企業(yè)所得稅，但是不得用于減免繳納的附加稅。因此，小微企業(yè)虧損時，仍然應當按照規(guī)定繳納附加稅。 
 
拓展知識：附加稅是指地方政府對企業(yè)經(jīng)濟活動進行收稅，分為營業(yè)稅、增值稅、土地增值稅、房產(chǎn)稅、印花稅等，附加稅收入主要用于支持當?shù)亟?jīng)濟發(fā)展和基礎設施建設。