企業(yè)研究開發(fā)費用是以研發(fā)項目為單位進行歸集的，企業(yè)應當按照規(guī)定的程序確定研發(fā)項目，即進行立項管理。根據有關規(guī)定，企業(yè)的每個研究開發(fā)項目，應當首先由企業(yè)按照規(guī)定的程序進行立項，并明確研發(fā)項目的研發(fā)形式、研發(fā)目標、進度計劃、經費預算、人員組成，并加強研發(fā)過程管理，在會計期末應當對研究開發(fā)費用發(fā)生情況進行歸集。每個年度終了或項目完成時，對項目實施情況或完成情況進行總結。主管稅務機關對企業(yè)享受加計扣除優(yōu)惠的研究開發(fā)項目有異議的，可以轉請地市級(含)以上科技行政主管部門出具鑒定意見，科技部門應及時回復意見。企業(yè)承擔省部級(含)以上科研項目的，以及以前年度已鑒定的跨年度研發(fā)項目，不再需要鑒定。