房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)的土地使用稅在稅款的計(jì)算方面并沒有什么特別的規(guī)定。其計(jì)算公式仍然為：應(yīng)納稅額=計(jì)稅土地面積×適用稅率。對(duì)此，《中華人民共和國(guó)城鎮(zhèn)土地使用稅暫行條例》第三條作了明確規(guī)定：“土地使用稅以納稅人實(shí)際占用的土地面積為計(jì)稅依據(jù)，依照規(guī)定稅額計(jì)算征收。”
如果硬要說有什么不同，那么就是有關(guān)稅收優(yōu)惠政策上的區(qū)別，即房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)用于建造商品房的土地曾經(jīng)有過一定的稅收優(yōu)惠。國(guó)家稅務(wù)局《關(guān)于印發(fā)〈關(guān)于土地使用稅若干具體問題的補(bǔ)充規(guī)定〉的通知》(國(guó)稅〔89〕地字第140號(hào))曾明確規(guī)定：房地產(chǎn)開發(fā)公司建造商品房的用地，原則上應(yīng)按規(guī)定征收土地使用稅。但鑒于其在商品房出售之前納稅確有困難的具體情況，對(duì)房地產(chǎn)開發(fā)公司征地后商品房在建期間占用的土地(有償轉(zhuǎn)讓使用的除外)，暫緩征收土地使用稅。對(duì)建成后的商品房占地及院落，從辦理驗(yàn)收手續(xù)之次月起征收土地使用稅。在辦理驗(yàn)收手續(xù)前已使用或出租出借的商品房占地及院落，應(yīng)按規(guī)定征收土地使用稅。在商品房出售后，按土地使用權(quán)轉(zhuǎn)移的歸屬情況劃分征免。
不過，按照國(guó)家稅務(wù)總局《關(guān)于取消部分地方稅行政審批項(xiàng)目的通知》(國(guó)稅函〔2007〕629號(hào))已經(jīng)明確規(guī)定取消房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)的這一優(yōu)惠，因而，自2007年6月11日起，也就是上述文件發(fā)布之日起，房地產(chǎn)開發(fā)公司征地后商品房在建期間占用的土地也必須按照規(guī)定計(jì)算繳納土地使用稅