主要有三種征收方式：查賬征收、查定征收和定期定額征收。
1.查賬征收：稅務(wù)機關(guān)按照納稅人提供的賬表所反映的經(jīng)營情況，依照適用稅率計算繳納稅款的方式。這種方式一般適用于財務(wù)會計制度較為健全，能夠認真履行納稅義務(wù)的納稅單位。
2.查定征收：稅務(wù)機關(guān)根據(jù)納稅人的從業(yè)人員、生產(chǎn)設(shè)備、采用原材料等因素，對其產(chǎn)制的應(yīng)稅產(chǎn)品查定核定產(chǎn)量、銷售額并據(jù)以征收稅款的方式。這種方式一般適用于賬冊不夠健全，但是能夠控制原材料或進銷貨的納稅單位。
3.定期定額征收：稅務(wù)機關(guān)通過典型調(diào)查、逐戶確定營業(yè)額和所得額并據(jù)以征稅的方式。這種方式一般適用于無完整考核依據(jù)的小型納稅單位。
第一個問題：你說的按發(fā)票進項和銷項抵扣之后征收的是查賬征收  第二個問題：不同的征收方式而已。不同企業(yè)適用不同方式